U svom radu na projektima, RRA koristi pristup prihvaćen u EU – metodlogija upravljanja projektnim ciklusom. Početkom 90-ih godina Evropska komisija usvojila je princip metodologije upravljanja projektnim ciklusom kao osnovni alat za izradu i upravljanje projektima utemeljen na principu logičke matrice s ciljem unapređivanja kvaliteta projekata. Dotad je navedenu metodologiju sprovodio niz međunarodnih organizacija kao što su Ujedinjene nacije, Evropska banka za obnovu i razvoj te Svjetska banka.
RRA je u svom radu na projektima ovu metodologiju u potpunosti prihvatila, kako u pripremi tako i u izvođenju projekata, i svoje iskustvo i znanje stečeno kroz obuke i kroz sam rad prenosi na ostale aktere u regionu. Neki od projekata koje je agencija na ovaj način sprovodila su:
